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J-GLOBAL ID：202002287452904883   整理番号：20A1181242

感染症に対する微生物無細胞DNAシークエンシング試験の分析的および臨床的検証【JST・京大機械翻訳】

Analytical and clinical validation of a microbial cell-free DNA sequencing test for infectious disease

著者 (23件)： Blauwkamp Timothy A. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Thair Simone (Department of Emergency Medicine, Stanford University, Palo Alto, CA, USA) ,  Rosen Michael J. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Blair Lily (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Lindner Martin S. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Vilfan Igor D. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Kawli Trupti (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Christians Fred C. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Venkatasubrahmanyam Shivkumar (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Wall Gregory D. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Cheung Anita (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Rogers Zoee N. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Meshulam-Simon Galit (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Huijse Liza (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Balakrishnan Sanjeev (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Quinn James V. (Department of Emergency Medicine, Stanford University, Palo Alto, CA, USA) ,  Hollemon Desiree (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Hong David K. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Vaughn Marla Lay (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Kertesz Mickey (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Bercovici Sivan (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Wilber Judith C. (Karius, Inc., Redwood City, CA, USA) ,  Yang Samuel (Department of Emergency Medicine, Stanford University, Palo Alto, CA, USA)
資料名： Nature Microbiology  (Nature Microbiology)
巻： 4  号： 4  ページ： 663-674  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4779A  ISSN： 2058-5276  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 数千の病原体はヒトに感染することが知られているが,現在の診断法を用いて画分のみが容易に同定できる。微生物無細胞DNA配列決定は,体全体にわたる広範囲の感染を非侵襲的に同定する可能性を提供するが,臨床グレードのメタゲノム試験の課題を解決しなければならない。ここでは,臨床的に関連する細菌,DNAウイルス,真菌類および真核生物寄生虫の血漿中の微生物無細胞DNAを同定し定量化する次世代シークエンシング試験の分析的および臨床的検証について述べる。試験精度,バイアス,および多くのメタゲノム特異的挑戦に対するロバスト性を,358の工夫された血漿試料における性能の重要な決定因子をモデル化した13の微生物パネルと,in silicoおよび580の臨床研究サンプルにおいてシミュレートされた2,625の感染を用いて測定した。試験は,敗血症警告患者350名のコホートにおいて血液培養と93.7%一致し,微生物学的試験の全て(169の病原学的測定対132)よりも,敗血症警告の独立した調整原因をより多く同定した。試験した方法のいずれによっても同定された敗血症病原性を持たない166試料の中で,配列決定は62の微生物無細胞DNAを同定した。CLIA実験室で試験された最初の2000人の患者試料の分析は,85%以上の結果が試料受取後の日に供給され,53.7%の報告が1つ以上の微生物を同定することを示した。感染症の診断として患者試料から直接無細胞DNAのメタゲノム配列決定を評価する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Limited 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 警報 ,  *微生物 ,  血漿 ,  細菌 ,  寄生虫 ,  ヒト ,  真菌類 ,  病原体 ,  真核生物 ,  敗血症 ,  ロバスト性 ,  細菌感染症
準シソーラス用語： *配列解析 ,  in silico ,  メタゲノム ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 微生物検査  (GC02030H)

タイトルに関連する用語 (7件)： 感染症 ,  微生物 ,  無細胞DNA ,  シークエンシング ,  試験 ,  臨床 ,  検証