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J-GLOBAL ID:202002287891190958   整理番号:20A1063172

統合失調症リスク変異体は選別ネキシン19(SNX19)の複数クラスの転写産物に影響する【JST・京大機械翻訳】

Schizophrenia risk variants influence multiple classes of transcripts of sorting nexin 19 (SNX19)
著者 (26件):
資料名:
巻: 25  号:ページ: 831-843  発行年: 2020年 
JST資料番号: A1362A  ISSN: 1359-4184  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: ドイツ (DEU)  言語: 英語 (EN)
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ゲノムワイド関連研究(GWAS)は統合失調症のリスクに関連する多くのゲノム遺伝子座を同定しているが,疾患関連変異体と特異的遺伝子の間の関係の明確な同定,特にリスク付与転写物に及ぼすそれらの影響は困難であることが証明されている。11q25における統合失調症遺伝子座における特異的分子機構をより良く理解するために,死後ヒト脳試料を用いてこの2つのメガバーゼゲノム領域に対するcis発現量的形質遺伝子座(cis-eQTL)マッピングを行った。局所的発現に及ぼす遺伝的リスクの影響を包括的に評価するために,多重転写物の特徴を評価した:複数の脳領域-背外側前頭前野(DLPFC),海馬,および尾状核における遺伝子,エキソン,およびエキソン-エクソン接合。遺伝的リスク変異体は,SNX19転写物の複数の稀なクラスをタグするSNX19転写物の発現と強く関連していたが,それらは大量の転写産物の大部分をタグするエキソン-エクソンジャンクションの発現には弱い影響しか及ぼさなかった。SNX19リスク関連転写産物の最も顕著なクラスは過剰発現しており,エキソン8と10(接合8.10)間のエキソン-エキソンスプライス結合により定義され,特徴的なネキシンC末端ドメインを欠く蛋白質をコードすると予測される。リスク対立遺伝子は,転写物の複数の追加クラスの増加または減少した発現とも関連していた。RACE,分子クローニングおよび長い読み取り配列決定により,著者らは,潜在的病原性転写産物のセットをさらに定義する多数の新規SNX19転写産物を見出した。SNX19発現の後成的調節を探索し,一次転写開始部位とエキソン2内のCpG部位におけるDNAメチル化がリスク関連発現に及ぼすリスク変異体の影響を部分的に仲介することを見出した。ATAC配列決定により,最も強いリスク関連SNPのいくつかはオープンクロマチン領域内に位置し,近傍調節要素が関与していることを示唆した。これらの知見は,統合失調症に対するリスク対立遺伝子がSNX19転写物の複数クラスのエピジェネティックな変化と調節不全を生じる潜在的に複雑な分子病因を示す。Copyright Springer Nature Limited 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (5件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
精神科の基礎医学  ,  精神障害  ,  遺伝子発現  ,  遺伝的変異  ,  分子遺伝学一般 

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