文献

J-GLOBAL ID：202002288111951430   整理番号：20A0662823

ペプチドの振動円偏光二色性スペクトルの解析:VCDツールを用いた小ペプチドモデルの一般化結合振動子アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Vibrational Circular Dichroism Spectra of Peptides: A Generalized Coupled Oscillator Approach of a Small Peptide Model Using VCDtools

著者 (5件)： Koenis Mark A. J. (Van’t Hoff Institute for Molecular Sciences, University of Amsterdam, The Netherlands) ,  Visscher Lucas (Amsterdam Center for Multiscale Modeling, Section Theoretical Chemistry, Faculty of Sciences, Vrije Universiteit Amsterdam, The Netherlands) ,  Buma Wybren J. (Van’t Hoff Institute for Molecular Sciences, University of Amsterdam, The Netherlands) ,  Buma Wybren J. (Institute for Molecules and Materials, FELIX Laboratory, Radboud University, The Netherlands) ,  Nicu Valentin P. (Department of Environmental Science, Physics, Physical Education and Sport, Lucian Blaga University of Sibiu, Romania)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 124  号： 9  ページ： 1665-1677  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 振動円偏光二色性(VCD)は,ペプチドを研究するための主要な分光学的ツールの1つである。それにもかかわらず,アミドI及びアミドIIスペクトル領域におけるこれらの化合物のVCDバンドの符号及び強度を決定する完全な理解はまだ完全ではない。本研究では,最近開発された新しいアプローチである一般結合発振器(GCO)解析を用いて,これらのVCD信号の起源を研究した。このアプローチを,α-ヘリックスおよびβ-シート配置の両方において,ForValNHMeモデルペプチドに適用した。アミドI及びアミドIIスペクトル領域で観測された強いVCD信号は本質的に同じ基礎機構,すなわち電気双極子の空間結合を持つことを示した。VCD強度の決定における分子内水素結合により果たされる重要な役割も示した。さらに,標準的なVCDモデルにおいて重要でないと考えられる回転強度への寄与はかなりの大きさを持ち,必ずしも無視できないことを見出した。さらに,アミドIおよびIIモードのVCDロバスト性を,線形輸送走査中の回転強度およびその寄与項の変化を監視し,異なる計算パラメータによる計算を行うことにより調べた。これらの研究から,特に,GCO解析により回転強度の分解が可能となり,以前に提案されたようにロバスト性の尺度を採用する場合には,一つは注意深くなければならないことが明らかになった。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *スペクトル ,  回転強度 ,  走査 ,  *ペプチド ,  線形性 ,  分子内水素結合 ,  ロバスト性 ,  電気双極子
準シソーラス用語： 分光学 ,  振動円偏光二色性 ,  結合振動子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  有機化合物の赤外スペクトル及びRaman散乱,Ramanスペクトル  (BM08064T)

タイトルに関連する用語 (8件)： ペプチド ,  振動円偏光二色性スペクトル ,  解析 ,  VCD ,  ツール ,  モデル ,  一般化 ,  結合振動子