文献

J-GLOBAL ID：202002288493730331   整理番号：20A0210398

染色体レベルのゲノムアセンブリーは,イネ科害虫,Chilo suppressalisにおける耐寒性の遺伝的基礎を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

A chromosome-level genome assembly reveals the genetic basis of cold tolerance in a notorious rice insect pest, Chilo suppressalis

著者 (17件)： Ma Weihua (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, National Centre of Plant Gene Research, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Zhao Xianxin (State Key Laboratory of Rice Biology & Ministry of Agricultural and Rural Affairs Key Laboratory of Molecular Biology of Crop Pathogens and Insect Pests, Institute of Insect Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang, China) ,  Yin Chuanlin (State Key Laboratory of Rice Biology & Ministry of Agricultural and Rural Affairs Key Laboratory of Molecular Biology of Crop Pathogens and Insect Pests, Institute of Insect Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang, China) ,  Jiang Fan (College of Informatics, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Du Xiaoyong (College of Informatics, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Chen Taiyu (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, National Centre of Plant Gene Research, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Zhang Qinghua (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, National Centre of Plant Gene Research, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Qiu Lin (College of Plant Protection, Hunan Agricultural University, Changsha, Hunan, China) ,  Xu Hongxing (Institute of Plant Protection and Microbiology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou, Zhejiang, China) ,  Joe Hull J. (Department of Agriculture, U.S. Agricultural Research Service, U.S. Arid Land Agricultural Research Center, Maricopa, AZ, USA) ,  Li Guoliang (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, National Centre of Plant Gene Research, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Li Guoliang (College of Informatics, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Sung Wing-Kin (College of Informatics, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China) ,  Sung Wing-Kin (Department of Computer Science, National University of Singapore, Singapore, Singapore) ,  Sung Wing-Kin (Department of Computational and Systems Biology, Genome Institute of Singapore, Singapore, Singapore) ,  Li Fei (State Key Laboratory of Rice Biology & Ministry of Agricultural and Rural Affairs Key Laboratory of Molecular Biology of Crop Pathogens and Insect Pests, Institute of Insect Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang, China) ,  Lin Yongjun (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, National Centre of Plant Gene Research, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 20  号： 1  ページ： 268-282  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イネ茎の雄rer,Chilo抑制は世界中でイネ生産に最も害を与えている害虫の1つである。C.suppressalisは低温耐性と休眠,植物-昆虫相互作用,農薬標的と耐性,RNAi仲介害虫管理の開発を調べる多くの研究の焦点であるが,高品質ゲノムの欠如はより深い洞察を制限している。この限界に取り組むために,IllinaとPacBio配列の両方から構築されたドラフトC.suppressalisゲノムを作成した。組み立てられたゲノムサイズは,307kbのコンティグN_50と1.75Mbの足場N_50を有する824.35Mbであった。Hi-C足場は,塩基の99.2%を29の染色体の1つに割り当てた。普遍的単一コピーオーソログ(BUSCO)に基づいて,ドラフトゲノム集合は97%完全と推定され,15653蛋白質コード遺伝子を網羅すると予測された。耐寒性は動物に見られる極端な生存戦略である。しかし,C.suppressalisの冬季生態の遺伝的基礎に関してはほとんど知られていない。ここでは,動物の耐寒性に関連するこれらの遺伝子ファミリーに関する著者らのオーソログ解析に焦点を当てた。著者らの発見は,グルコース起源のグリセロール生合成,トリアシルグリセロールに起因するグリセロール生合成,脂肪酸合成およびトレハロース輸送-中間耐寒性に関与するそれらを含む,C.suppressalisにおける特異的耐寒性戦略を明らかにする最初のゲノム証拠を提供した。高品質C.suppressalisゲノムは,分子生態学における広範囲の領域への研究のための価値ある資源を提供し,その後,現代の害虫防除戦略の開発に役立つ。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *ゲノム ,  *ニカメイガ ,  冬 ,  タンパク質 ,  *害虫 ,  遺伝子 ,  *染色体 ,  相互作用 ,  *イネ科 ,  害虫防除 ,  生態 ,  生合成 ,  RNA干渉 ,  トリグリセリド

著者キーワード (7件)： Chilo抑制剤 ,  耐寒性 ,  脂肪酸合成 ,  遺伝的基礎 ,  ゲノム構築 ,  グリセロール生合成 ,  トレハロース輸送

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 染色体 ,  ゲノム ,  アセンブリー ,  イネ科 ,  害虫 ,  Chilo ,  耐寒性 ,  遺伝 ,  基礎