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J-GLOBAL ID:202002288500016133   整理番号:20A2696772

膀胱癌患者の生存に及ぼす微小環境と関連した長鎖非コードRNAの影響【JST・京大機械翻訳】

Impact of Long Non-coding RNAs Associated With Microenvironment on Survival for Bladder Cancer Patients
著者 (6件):
資料名:
巻: 11  ページ: 567200  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7071A  ISSN: 1664-8021  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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背景:膀胱癌を含むいくつかの腫瘍研究からの累積証拠は,腫瘍形成,発生および転移における腫瘍微小環境(TME)の重要性を強調し,これは長い非コードRNA(lncRNA)により調節可能である。本研究は,BC患者の生存を予測するそれらの予後値に対する膀胱癌(BC)微小環境関連lncRNAの同定を目的とする。方法:lncRNA発現と対応する臨床的特徴に関するBC患者のデータを,癌ゲノムアトラス(TCGA)から得た。Cox回帰分析と最小絶対収縮と選択オペレータ(LASSO)回帰分析を行い,各試料の免疫スコアの計算に従ってlncRNAをスクリーニングした。スクリーニングしたlncRNAsに対して,リスクスコアモデルを構築し,生存を予測し,3および5年全生存率(OS)率をノモグラムを用いて評価した。較正曲線と一致指数(C指数)はノモグラムの性能を検証した。最後に,スクリーニングlncRNAsに関連する潜在的機能を探索するために,遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子およびゲノム(KEGG)濃縮分析の京都エンシクロペディアを実施した。結果:多変量Cox回帰分析は,腫瘍進行に影響する独立因子と考えられる5つのTME関連lncRNAをスクリーニングした。対応するリスクスコアモデルを以下の通り確立した。(-0.15816 AC064805.1)+(0.10015 AC084033.3) +(-0.17977 AC092112.1)+(-0.05673AC103691.1)+(0.17789 AL391704.1)+(-0.1258 LINC00892)。ノモグラムのC指数は0.63(95%CI:0.625~0.635)であった。また,較正曲線は,ノモグラム予測と実際の観察の間の良好な一致を示すことによって,予測有効性を検証した。GOとKEGG分析は,6つのTME関連lncRNAが,腫瘍転移と進行にリンクする可能性が最も高いことを示した。結論:本研究は,TMEにおける独立した免疫バイオマーカーとして6つのlncRNAsを決定し,それらの予後値を予測するノモグラムを構築し,BCの進行におけるそれらの調節役割を理解するための潜在的生物学的過程を調査した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
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腫ようの化学・生化学・病理学  ,  遺伝子発現 
引用文献 (39件):
  • AlfredW. J.LebretT.CompératE. M.CowanN. C.De SantisM.BruinsH. M. (2017). Updated 2016 EAU Guidelines on Muscle-invasive and Metastatic Bladder Cancer. Eur. Urol. 71 462-475. doi: 10.1016/j.eururo.2016.06.020 27375033
  • BabjukM.BöhleA.CapounO.CohenD.CompératE. M. (2017). EAU Guidelines on Non-Muscle-invasive Urothelial Carcinoma of the Bladder: Update 2016. Eur. Urol. 71 447-461. doi: 10.1016/j.eururo.2016.05.041 27324428
  • BhanA.SoleimaniM.MandalS. S. (2017). Long Noncoding RNA and Cancer: A New Paradigm. Cancer Res. 77:3965-3981. doi: 10.1158/0008-5472
  • BussemakersM. J.van BokhovenA.SmitF. P.KarthausH. F.SchalkenJ. A. (1999). DD3: a new prostate-specific gene, highly overexpressed in prostate cancer. Cancer Res. 59 5975-5979.
  • CaiC.YangL.WangH.HeY.JiangH. (2019). Prediction of Overall Survival in Gastric Cancer Using a Nine-lncRNA. DNA Cell Biol. 38 1005-1012. doi: 10.1089/dna.2019.4832 31335180
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