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J-GLOBAL ID：202002288577046458   整理番号：20A1590778

ボタンとシャクヤク属の他の5つの葉緑体ゲノムの特徴の比較【JST・京大機械翻訳】

Comparative Analysis of Chloroplast Genome Characteristics between Paeonia jishanensis and Other Five Species of Paeonia

著者 (7件)： Zhou Xiaojun (洛陽師范学院生命科学学院 洛陽471934) ,  Zhang Kai (河南小秦嶺国家級自然保護区管理局 三門峡472500) ,  Peng Zhengfeng (洛陽牡丹研究院 洛陽471000) ,  Sun Shanshan (洛陽師范学院生命科学学院 洛陽471934) ,  Ya Huiyuan (洛陽師范学院生命科学学院 洛陽471934) ,  Zhang Yanzhao (洛陽師范学院生命科学学院 洛陽471934) ,  Cheng Yanwei (洛陽師范学院生命科学学院 洛陽471934)
資料名： Linye Kexue  (Linye Kexue)
巻： 56  号： 4  ページ： 82-88  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2424A  ISSN： 1001-7488  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]中国特有の野生ボタンは国内外で貴重な生殖質資源と見なされている。野生矮牡丹は現代栽培ボタン品種の重要な祖先種の一つと考えられ、矮ボタンを展開するシャクヤク属植物の葉緑体ゲノム(cpDNA)の特徴解析は、ボタン系統の進化、育成と改良栽培品種の解明に重要な理論的と実践的価値を持つ。[方法]矮性ボタンの葉緑体のハイスループットシークエンシングに基づいて、NCBIデータベースから、ホダンボタン、オオカクイロウボタン、雲南牡丹、川赤芍と草芍薬のcpDNAデータをダウンロードし、Geneious8.0、EMBOSS6.4.0などのソフトウェアを利用した。シャクヤク属の6種類のcpDNAに対して比較分析を行った。【結果】152628bpのcpDNA配列は,合計112の遺伝子を持ち,78の蛋白質をコードする25988のコドンをコード化した。4つのrRNA、7つのtRNA、8つのタンパク質コード遺伝子を含む19の遺伝子はIR(逆反復)区に重複する。合計143のSSR遺伝子座を検索し、一塩基反復モチーフ部位が最も多く、116個(81.12%を占める)で、ヘキサヌクレオチド反復モチーフはなかった。シャクヤク属の葉緑体ゲノムは比較的保守的であるが、異なる種間のIRとLSC(大単コピー区)の境界位置は依然一定の変化があり、ホテイボタンのLSC/IRのrpl2遺伝子は718bpからLSC領域まで延び、他の種のrpl2遺伝子はIR区に完全に位置している。[結論]ゲノムサイズと遺伝子内容から見ると、シャクヤク属cpDNAは高度に保存されており、シャクヤクヤクヤクヤクとカクヤクのcpDNAは最大で、152698bpであり、ホテイボタンのcpDNAは最小で、152153bpであった。A/T塩基,SSRs部位の塩基組成,A/T塩基,143のSSRs遺伝子座,A/Tからなる遺伝子座の134の遺伝子座が,A/T塩基とSSRsのヌクレオチド配列に好ましかった。矮性ボタンcpDNASSRsの分布は不均一性があり、14個のSSR遺伝子座はIR区に位置し、103個はLSC区に位置し、26個はSSC区に位置した。IR境界分析によると、シャクヤク属LSC/IRbの境界変化はIR区の拡張と収縮の主な原因である。研究結果はシャクヤク属植物の系統進化と栽培起源などの研究に支持を提供し、シャクヤク属植物の分子マーカーの開発及び優良品種の選別育成に参考価値がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  rRNA ,  tRNA ,  遺伝子 ,  *葉緑体 ,  タンパク質 ,  ヌクレオチド配列 ,  系統発生 ,  栽培 ,  ソフトウェア ,  *シャクヤク ,  矮性 ,  栽培品種
準シソーラス用語： 葉緑体DNA ,  配列解析 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 植物分類学  (EH01030N) ,  森林植物学  (FF02020E)

タイトルに関連する用語 (3件)： ボタン ,  シャクヤク ,  葉緑体ゲノム