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J-GLOBAL ID：202002288946195115   整理番号：20A0454746

潜在部位開口の構造に基づく解析【JST・京大機械翻訳】

Structure-Based Analysis of Cryptic-Site Opening

著者 (7件)： Sun Zhuyezi (Department of Biomedical Engineering, Boston University, Boston, MA 02215, USA) ,  Wakefield Amanda Elizabeth (Department of Biomedical Engineering, Boston University, Boston, MA 02215, USA) ,  Wakefield Amanda Elizabeth (Department of Chemistry, Boston University, Boston, MA 02215, USA) ,  Kolossvary Istvan (Department of Biomedical Engineering, Boston University, Boston, MA 02215, USA) ,  Beglov Dmitri (Department of Biomedical Engineering, Boston University, Boston, MA 02215, USA) ,  Vajda Sandor (Department of Biomedical Engineering, Boston University, Boston, MA 02215, USA) ,  Vajda Sandor (Department of Chemistry, Boston University, Boston, MA 02215, USA)
資料名： Structure  (Structure)
巻： 28  号： 2  ページ： 223-235.e2  発行年： 2020年 
JST資料番号： A1212A  ISSN： 0969-2126  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： それらの非結合構造における多くの蛋白質は,薬物結合のために適切にサイズされていない潜在的部位を有する。ここでは,最近発表されたクリプトサイトセットから32の蛋白質を検証し,その部位がサイト近くに結合することなく,蛋白質の全ての利用可能なX線構造において潜在的なままであるかどうかを検討した。これらの蛋白質のほとんどはリガンド結合なしに形成されない結合ポケットを有することを示した。いくつかの構造において潜在的であるが,他に自発的に形成されるサイトも稀である。ほとんどの蛋白質において,ポケットの形成は,クリプトサイトから遠い場所での突然変異またはリガンド結合により影響される。これらの機構をさらに調べるために,断熱バイアス分子動力学シミュレーションを適用して,それらのリガンドフリー構造からリガンド結合立体配座への蛋白質を誘導し,潜在部位に位置するポケットの薬剤性スコアの分布を研究した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  バイアス ,  開口 ,  突然変異 ,  結合部位 ,  立体配座
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  リガンド結合 ,  X線構造 ,  陰窩 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 誘導適合 ,  立体配座選択 ,  結合ポケット ,  医薬品 ,  配位子結合 ,  alloリー

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (1件)： 解析