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J-GLOBAL ID：202002290640227281   整理番号：20A2213982

老齢ブナ林におけるSNPの微細スケール空間パターンの評価【JST・京大機械翻訳】

Assessments of fine-scale spatial patterns of SNPs in an old-growth beech forest

著者 (7件)： Tsukamoto Masashi (Department of Sustainable Resource Sciences, Graduate School of Bioresources, Mie University, Tsu, Japan) ,  Akada Shinji (Department of Applied Biology and Food Sciences, Faculty of Agriculture and Life Science, Hirosaki University, Hirosaki, Japan) ,  Matsuda Shuichi (Department of Applied Biology and Food Sciences, Faculty of Agriculture and Life Science, Hirosaki University, Hirosaki, Japan) ,  Jouyu Hitomi (Department of Applied Biology and Food Sciences, Faculty of Agriculture and Life Science, Hirosaki University, Hirosaki, Japan) ,  Kisanuki Hiromitsu (Department of Sustainable Resource Sciences, Graduate School of Bioresources, Mie University, Tsu, Japan) ,  Tomaru Nobuhiro (Graduate School of Bioagricultural Sciences, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Torimaru Takeshi (Department of Sustainable Resource Sciences, Graduate School of Bioresources, Mie University, Tsu, Japan)
資料名： Heredity  (Heredity)
巻： 125  号： 4  ページ： 240-252  発行年： 2020年 
JST資料番号： C0547A  ISSN： 0018-067X  CODEN： HDTYA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微細空間スケールにおける非中立遺伝的変異の空間パターンと微小環境とのそれらの可能な関連は,樹木個体群に対して十分に証明されていない。25-32SNPマーカーに基づいて,非中性SNPとそれらの微小環境との会合が,Fagus crenataの成熟個体群における1haプロットにおける166の成体樹木に対するArabidopsis thalianaの干ばつストレスにより誘導された蛋白質をコードしている遺伝子であるFcMYB1603において検出できるかどうかを調べた。キャノピー樹木以下の若いコホートの83個体において,遺伝子座FcMYB1603_684における非同義SNPは,中立遺伝的変異の予想される空間パターンからの逸脱を示す空間シグネチャを示した。この遺伝子座に対する非中立性の評価は,少数のSNP遺伝子座,マイナーアレル頻度に対する低い基準セット,および樹木の空間構造に対する任意のエッジ効果による偽陽性の潜在的リスクに対してロバストであった。古いコホートは,非中立的遺伝的変異の存在のシグナルを示さず,森林床上の微小環境条件における時間的変動が,選択圧の異なる大きさに異なるコホートを曝露することを示唆した。遺伝子座の遺伝子型は土壌水分に潜在的に関連する微環境変数と空間的関連を示したが,本研究は,単一プロット内の非同義遺伝子座の一般的に低い多型による制限を受け,微細スケール非中立遺伝的変異に関する研究を行うための研究設計を複製することが重要であることを示唆した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to The Genetics Society 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  遺伝子型 ,  タンパク質 ,  干ばつ ,  成体 ,  *老年 ,  土壌水 ,  個体群 ,  母集団 ,  ロバスト性 ,  遺伝子頻度 ,  Arabidopsis thaliana
準シソーラス用語： 微小環境 ,  遺伝的変異 ,  同義置換 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 森林植物学  (FF02020E) ,  集団遺伝学  (EC01040J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 老齢 ,  ブナ林 ,  SNP ,  微細 ,  スケール空間 ,  評価