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J-GLOBAL ID：202002290730525092   整理番号：20A0201558

全ゲノムSNP,MLSTおよびPFGEタイピングに基づくMoraxella catarrhalis分離株のCC224,CC363,CC449およびCC446における遺伝子型差【JST・京大機械翻訳】

Genotypic differences in CC224, CC363, CC449 and CC446 of Moraxella catarrhalis isolates based on whole genome SNP, MLST and PFGE typing

著者 (16件)： Liu Ya-Li (Department of Laboratory Medicine, Peking Union Medical College Hospital, Peking Union Medical College, 100730, Beijing, China) ,  Liu Ya-Li (Graduate School, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences, 100730, Beijing, China) ,  Liu Ya-Li (Beijing Key Laboratory for Mechanisms Research and Precision Diagnosis of Invasive Fungal Diseases (BZ0447), 100730, Beijing, China) ,  Yu Shu-Ying (Department of Laboratory Medicine, Peking Union Medical College Hospital, Peking Union Medical College, 100730, Beijing, China) ,  Yu Shu-Ying (Graduate School, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences, 100730, Beijing, China) ,  Yu Shu-Ying (Beijing Key Laboratory for Mechanisms Research and Precision Diagnosis of Invasive Fungal Diseases (BZ0447), 100730, Beijing, China) ,  Jia Xin-Miao (Department of Medical Research Center, Peking Union Medical College Hospital, Peking Union Medical College & Chinese Academy of Medical Sciences, 100730, Beijing, China) ,  Zhou Hai-Jian (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, 102206, Beijing, China) ,  Sun Hong-Li (Department of Laboratory Medicine, Peking Union Medical College Hospital, Peking Union Medical College, 100730, Beijing, China) ,  Sun Hong-Li (Beijing Key Laboratory for Mechanisms Research and Precision Diagnosis of Invasive Fungal Diseases (BZ0447), 100730, Beijing, China) ,  Kudinha Timothy (Charles Sturt University, Orange Campus, Orange, NSW, Australia) ,  Kudinha Timothy (Laboratory Services, ICPMR - Pathology West, Westmead Hospital, University of Sydney, Westmead, NSW, Australia) ,  Kong Fanrong (Laboratory Services, ICPMR - Pathology West, Westmead Hospital, University of Sydney, Westmead, NSW, Australia) ,  Xu He-Ping (Department of Clinical Laboratory, the First Affiliated Hospital of Xiamen University, Xiamen, China) ,  Xu Ying-Chun (Department of Laboratory Medicine, Peking Union Medical College Hospital, Peking Union Medical College, 100730, Beijing, China) ,  Xu Ying-Chun (Beijing Key Laboratory for Mechanisms Research and Precision Diagnosis of Invasive Fungal Diseases (BZ0447), 100730, Beijing, China)
資料名： International Journal of Medical Microbiology  (International Journal of Medical Microbiology)
巻： 310  号： 1  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1759A  ISSN： 1438-4221  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マクロライド耐性からマクロライド耐性生物へのM.catarrhalisの進化経路を理解することは,増殖によるマクロライド抵抗性を妨害するために重要である。有用で実用的なタイピングツールとして,多遺伝子座配列タイピング(MLST),パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)および全ゲノムSNPタイピング(WGST)は,利点と欠点の両方を有する。これらの3つのタイピング法の有用性を,M.catarrhalisクローンとクローン複合体の特性化における一致,一貫性,および欠点のレベルを含めて研究した。著者らは4つのクローン複合体[CC224,CC363,CC449(CCN10)とCC446(CCN08)]に焦点を合わせ,PFGEとWGSTには高レベルの一致と同じクローンまたは非常に密接に関連したクローンの適切な一貫性があるが,MLSTは異なるクローンに対して識別性が低いことを見出した。さらに,「同じクローン」に対する進化距離カットオフ値も確立した。さらに,著者らは以前にマクロライド感受性クローン複合体と考えられていたCC224におけるマクロライド耐性M.catarrhalisを検出した。ST446と比較して,より多くの分離株はST215に属しており,ST215が主な創始者である可能性があることを意味した。著者らの研究は,すべての4つのクローン複合体が,M.catarrhalis系統1に属することを示した。それは,増加した病原性可能性と血清耐性に関連すると考えられる。また,copB IIはCC449に高度に関連し,LOS型Bは主にCC224に限定されていることを観察した。結論として,これらの知見は,M.catarrhalisの進化的特性へのさらなる洞察を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クローン ,  感受性 ,  複合体 ,  *Moraxella ,  病原性 ,  *遺伝子型 ,  キャラクタリゼーション ,  *ゲノム ,  血清 ,  *パルスフィールドゲル電気泳動
準シソーラス用語： カットオフ値 ,  マクロライド ,  マクロライド耐性 ,  *分離株 ,  *多座位配列タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Moraxella catarrhalis ,  多遺伝子座配列タイピング(MLST) ,  パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE) ,  全ゲノムSNPタイピング(WGST)

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  食品の汚染  (FJ01053P)

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  SNP ,  MLST ,  PFGE ,  タイピング ,  Moraxella ,  分離株 ,  遺伝子型