Panicum virgatum L.およびPanicum halliiにおけるガラクチノールシンターゼ(GolS)遺伝子の同定,進化および発現解析:in silicoアプローチ【JST・京大機械翻訳】

de Gois Eduardo Henrique Baltrusch; Menegazzo Renato Fernando; dos Santos Tiago Benedito; de Souza Silvia Graciele Huelse

文献

J-GLOBAL ID：202002290877888549 整理番号：20A2660866

Panicum virgatum L.およびPanicum halliiにおけるガラクチノールシンターゼ(GolS)遺伝子の同定,進化および発現解析:in silicoアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Identification, evolutionary and expression analysis of the galactinol synthase (GolS) genes in Panicum virgatum L. and Panicum hallii : An in silico approach

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巻： 24 ページ： Null 発行年： 2020年
JST資料番号： W3471A ISSN： 2352-4073 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

ガラクチノールシンターゼ(GS;EC2.4.1.123)はラフィノースファミリーオリゴ糖(RFO)生合成経路の最初の段階を触媒する重要な酵素である。ガラクチノールシンターゼ遺伝子(GolS)は単子葉植物と双子葉植物のゲノムにおいて複数の遺伝子によりコードされ,これらの対立遺伝子変異体は多くの生物学的過程に関与する。本研究は,2つのスイッチグラス種におけるGolS遺伝子の最初のゲノムワイド分析を提示する。Panicum virgatum L.およびP.Halliiゲノムにおける合計6つのGolS遺伝子/蛋白質を同定した。さらに,蛋白質長,分子量,理論的等電点および3D蛋白質構造に関して,in silico全PhGolSおよびPvGolS遺伝子を分析した。細胞内位置は主に細胞質として予測された。ゲノム構成は,ほとんどのPhGolSとPvGolS遺伝子が2つまたは3つのエキソンを持つことを明らかにした。その後,保存モチーフを同定した。それらはすべてのPhGolSおよびPvGolS蛋白質において高い群特異性を示した。PhGolSとPvGolS蛋白質の比較系統発生分析は,2つの異なるグループを明らかにした。Arabidopsis thaliana,Oryza sativa,Zea mays,およびBrachypodium distachyonのそれらとPanicum属におけるGolS遺伝子のシンテニー事象比較は,植物におけるGolS遺伝子が異なる起源を特色にし,それらのシンテニーが単子葉植物の間で保存されるいくつかのオルソロガス遺伝子の同定につながった。転写プロファイルはGolS遺伝子が異なる組織で発現し,これらの遺伝子が様々な生理学的機能に関与することを示した。まとめると,本研究から得られた結果は,これらの重要なスイッチグラス種におけるGolS遺伝子のさらなる機能的特性化のための貴重な情報を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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酵素生理 , 遺伝子発現

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