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J-GLOBAL ID：202002291710243521   整理番号：20A2530608

Cardamine hirsutaにおける開花関連MADSボックス遺伝子ファミリーの全ゲノム研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide study of flowering-related MADS-box genes family in Cardamine hirsuta

著者 (3件)： Ghorbani Marghashi Mahmood (Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran) ,  Bagheri Hedayat (Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran) ,  Gholami Mansour (Department of Horticulture, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran)
資料名： 3 Biotech  (3 Biotech)
巻： 10  号： 12  ページ： 518  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3974A  ISSN： 2190-5738  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： MADSボックス遺伝子は,特に生殖構造の発達と開花期の制御において,多様な生物学的機能に関与する。最近,Cardamine hirsutaは,発生の比較研究において,排他的に強力な遺伝的システムとして浮上している。C.hirsutaのゲノム配列は利用可能であるが,そのMADSボックスファミリー遺伝子の包括的な解析はまだ不足している。ここでは,バイオインフォマティクスツールを介して50のCardamine MADS-box遺伝子を決定し,系統発生分析に基づいて2Mβ,6Mαおよび2Mγおよび40MIKC型(35MIKCcおよび5MIKC*)遺伝子に分類した。C.hirsuta MIKCサブファミリーはArabidopsisとして14のサブグループにさらに分類できた。しかし,MADSボックス蛋白質の数はこれらのサブグループ間では等しくなかった。50MADSボックス遺伝子間の構造多様性に基づいて,2つの系統,タイプIとタイプIIを得た。I型遺伝子のMα,MβおよびMγ群では,イントロン(0または1)の最低数が認められた。最もCardamine MADSボックス遺伝子は3つの染色体のみにランダムに分布した。C.hirsutaはA.thalianaよりも比較的少数の開花MADSボックス遺伝子を持ち,おそらくタンデム重複事象はArabidopsisにおけるFLC,SQUAおよびTM3ファミリーメンバーの拡大をもたらした。さらに,保存モチーフの中で,SQUAのChMADS5,TM3のChMADS34およびAGL15ファミリーのChMADS51は,Kドメインを持たなかった。本研究は,C.hirsutaにおけるMADS-box遺伝子の更なる機能調査のための基礎を提供する。Copyright King Abdulaziz City for Science and Technology 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  生殖 ,  タンパク質 ,  系統発生 ,  *開花 ,  イントロン ,  Arabidopsis
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  バイオインフォマティクス ,  系統解析 ,  ゲノム配列 ,  *MADSボックス遺伝子 ,  開花期 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Arabidopsis ,  アブラナ科 ,  Kドメイン ,  MIKC ,  系統発生解析

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： Cardamine ,  開花 ,  MADSボックス遺伝子 ,  ファミリー ,  ゲノム ,  研究