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J-GLOBAL ID:202002292794668638   整理番号:20A2408765

肝内胆管癌の予後関連遺伝子をTCGAデータに基づいて予備的に探査した。【JST・京大機械翻訳】

Preliminary exploration of prognosis-related genes of intrahepatic cholangiocarcinoma based on TCGA database
著者 (5件):
資料名:
巻: 32  号:ページ: 494-498  発行年: 2020年 
JST資料番号: C3339A  ISSN: 1007-1954  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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目的:TCGAデータベースにおける肝内胆管癌(ICC)のハイスループットシークエンシングデータを分析し、その予後関連遺伝子を探し、リスクモデルを構築し、そのICC組織における発現及び作用経路を検討する。方法:TCGAデータベース中の33例のICC組織と8例の癌周囲組織中のRNA-seq発現マトリックスデータと患者の臨床資料情報をダウンロードし、edgeRソフトウェアパッケージを用いて遺伝子差次的発現分析を行い、単変量Cox回帰分析により予後関連差異遺伝子をスクリーニングした。差異遺伝子に対して生存曲線を描き、臨床意義のある遺伝子を選び、多因子Cox回帰分析によりリスクモデルを構築し、京都遺伝子とゲノム百科全書(KEGG)経路濃縮分析を通じて、予後関連遺伝子の作用経路を了解した。結果:edgeR分析後、6617個の差異遺伝子(スクリーニング基準は|log2FoldChange|>1、P<0.05)が得られ、そのうち高発現群は4094個、低発現群は2523個であった。機能濃縮により、これらの遺伝子は化学物の発癌作用、薬物代謝-チトクロームP450系、チトクロームP450の異バイオマスへの代謝影響及びレチノール代謝経路に集中していることが分かった。単変量Cox回帰、Rソフトウェア“survival”の生存曲線分析によると、UCN2、CST1、PROS1、SLC35E4、PEMTの五つの遺伝子はICC患者の予後に対して著しい影響がある。多変量Cox回帰分析により、CST1、PEMT、PROS1構築のリスクモデルはICC患者の予後に対して判断作用を有する。結論:UCN2、CST1、PROS1、SLC35E4、PEMT遺伝子はICC予後判断の指標となり、後続臨床試験にデータサポートを提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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消化器の腫よう  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
物質索引 (1件):
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