抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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クラスター化規則的空間間短パリンドローム反復(CRISPR)-Cas系のABSTRACT A多様性は,過去のウイルス感染の「記憶」を記録することにより,細菌と古細菌への適応免疫を提供する。最近,多くの新規CRISPR関連蛋白質が計算研究により発見されたが,これらの研究は集合ゲノムの偏った不完全なデータベースに依存する。これらのバイアスを回避し,環境メタゲノムから同定された微妙な生態学的共起性パターンを用いて,新しいCRISPR関連遺伝子を探索するためのネットワーク理論アプローチを適用した。既存のアノテーションを用いて本法を検証し,32の新規CRISPR関連遺伝子ファミリーを発見した。これらの遺伝子は,感染に対する応答を潜在的に調節する多くの推定機能に及んでいる。IMPORTANCEは,微生物寿命を含む生命の木上で,ウイルス病原体の脅威に直面している。共進化の10億年にわたって,原核生物はウイルス感染に対して防御する戦略の大きな多様性を進化させた。これらのうちの1つはCRISPR適応免疫システムであり,微生物が将来においてそれらをよりよく戦うために過去の感染を「記憶する」ことを可能にする。CRISPR免疫における分子生物学者の間には,このシステムが正確なゲノム編集のためのツールとして再利用できるため,多くの関心が持たれている。最近,多数の比較ゲノムアプローチが,ゲノムのデータベースにおける新規CRISPR関連遺伝子を検出するために使用され,新しいゲノム編集ツールの開発につながる可能性がある。ここでは,環境サンプル(”メタゲノム”)におけるこれら異なるクラスの遺伝子を直接探索する新しい方法を開発し,CRISPR関連遺伝子の自然多様性のより完全な描像を捉えた。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】