CUBE-DB

• Evolution of Protein Structure and Function Group, Biomolecular Modelling and Design Division, Bioinformatics Institute

ヒトのタンパク質ファミリーにおける機能的分岐を検出するためのデータベースです。ヒトタンパク質のマルチメンバーファミリーに属するパラログタンパク質中の残基について、事前評価した保存スコアおよび専門化スコアを収録しています。タンパク質ファミリーの分類は、HUGO Gene Nomenclature Committee によって提案された分類に(ほぼ)従っています。オーソロガスなタンパク質配列のセットは、Ensembl から入手可能な完全脊椎動物ゲノムを用いて、 mutual-best-hit 戦略により生成されました。ドキュメントページに記述されているスコアは、個々のタンパク質の残基に割り当てられ、表形式(html またはダウンロード可能な xls 形式)で表示されると同時に、適切な場合には、関連する構造(Jmol、Pymol、Chimera)にマッピングされます。