ViBE-Z: The Virtual Brain Explorer for Zebrafish

• Life Imaging Center (LIC), University of Freiburg

幼生ゼブラフィッシュの脳における仮想共局在研究のためのイメージングおよび画像解析フレームワークです。現在、72 hpf(受精後経過時間)、48 hpf、および 96 hpf の幼生が利用可能です。ViBE-Z は、正確に配置された遺伝子発現パターンのデータベース(1 μm^3 の分解能)、解剖学的アトラス、およびソフトウェアを含みます。このソフトウェアは、複数の共焦点顕微鏡画像スタックを融合し、これらのデータセットを標準的幼生に配置することで、高品質なデータセットを生成します。 データはHDF5フォーマットによるダウンロードが可能です。