資源
J-GLOBAL ID:202010000238662134   研究資源コード:NBDC02166 更新日:2020年07月09日

ViBE-Z: The Virtual Brain Explorer for Zebrafish

ViBE-Z: The Virtual Brain Explorer for Zebrafish
保有機関:
  • Life Imaging Center (LIC), University of Freiburg
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (3件): 発現 ,  分布 ,  画像/動画
生物種 (1件): Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955)
概要:
幼生ゼブラフィッシュの脳における仮想共局在研究のためのイメージングおよび画像解析フレームワークです。現在、72 hpf(受精後経過時間)、48 hpf、および 96 hpf の幼生が利用可能です。ViBE-Z は、正確に配置された遺伝子発現パターンのデータベース(1 μm^3 の分解能)、解剖学的アトラス、およびソフトウェアを含みます。このソフトウェアは、複数の共焦点顕微鏡画像スタックを融合し、これらのデータセットを標準的幼生に配置することで、高品質なデータセットを生成します。 データはHDF5フォーマットによるダウンロードが可能です。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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