資源
J-GLOBAL ID:202010000278118224   研究資源コード:NBDC02489 更新日:2020年01月21日

Pancan-meQTL: Pan-cancer methylation quantitative trait loci

Pancan-meQTL: Methylation quantitative trait loci in cancer
保有機関:
  • 華中科技大学
  • University of Texas Health Science Center at Houston
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (4件): ゲノム/遺伝子 ,  遺伝的多様性 ,  エピジェネティクス ,  健康/疾患
タグ【データの種類】 (3件): 配列 ,  表現型 ,  発現
生物種 (1件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要:
ゲノム全体の遺伝子型と統合したDNAメチル化の量的形質遺伝子座 (meQTL) を提供するデータベースです。ゲノムのメチル化レベルに対するSNPの影響を体系的に予測する目的で作成されました。Cancer Genome Atlas(TCGA)による遺伝子型とメチル化データを使用し、異なる種類のがんを対象として、cis-meQTLやtrans-meQTLの情報を提供します。各エントリにはSNP ID、SNPの位置、変異塩基、メチル化プローブ、メチル化位置、遺伝子名、P-valueなどを収録しています。さまざまな種類のがんにわたる患者の全生存率についてmeQLTやGWAS連鎖不均衡(LD)領域におけるmeQLTの閲覧、検索も可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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