Pancan-meQTL: Pan-cancer methylation quantitative trait loci

Pancan-meQTL: Methylation quantitative trait loci in cancer

保有機関：

華中科技大学
University of Texas Health Science Center at Houston

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (4件)：ゲノム/遺伝子 , 遺伝的多様性 , エピジェネティクス , 健康/疾患

タグ【データの種類】 (3件)：配列 , 表現型 , 発現

生物種 (1件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)

概要：

ゲノム全体の遺伝子型と統合したDNAメチル化の量的形質遺伝子座 (meQTL) を提供するデータベースです。ゲノムのメチル化レベルに対するSNPの影響を体系的に予測する目的で作成されました。Cancer Genome Atlas(TCGA)による遺伝子型とメチル化データを使用し、異なる種類のがんを対象として、cis-meQTLやtrans-meQTLの情報を提供します。各エントリにはSNP ID、SNPの位置、変異塩基、メチル化プローブ、メチル化位置、遺伝子名、P-valueなどを収録しています。さまざまな種類のがんにわたる患者の全生存率についてmeQLTやGWAS連鎖不均衡(LD)領域におけるmeQLTの閲覧、検索も可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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