資源
J-GLOBAL ID:202010000342845410
研究資源コード:NBDC02519
更新日:2020年04月14日
RNAct
RNAct
保有機関:
-
Centre for Genomic Regulation (CRG)
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
RNA
, タンパク質
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 相互作用/パスウェイ
生物種 (3件):
Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
, Saccharomycotina (NCBI Taxonomy ID: 147537)
概要:
モデル生物におけるタンパク質-RNA相互作用のデータベースです。実験データもしくはSONAR やcatRAPID (protein-RNA interaction prediction algorithm)による予測から得られたタンパク質-RNA相互作用に関連して、タンパク質についてはUniProt番号、遺伝子名、アミノ酸数、タンパク質の説明を、RNAについてはEnsembl Transcript ID、遺伝子名、転写ID、塩基対数などを収録しています。また相互作用について転写サポートレベル、予測スコアなども収録しています。タンパク質からとRNAからの検索が可能です。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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