PTMcode

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (1件)：タンパク質

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 相互作用/パスウェイ

生物種 (18件)： Aedes aegypti (NCBI Taxonomy ID: 7159) , Anopheles gambiae (NCBI Taxonomy ID: 7165) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Canis familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Felis catus (NCBI Taxonomy ID: 9685) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Macaca mulatta (NCBI Taxonomy ID: 9544) , Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Schizosaccharomyces pombe (NCBI Taxonomy ID: 4896) , Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)

概要：

相互作用タンパク質内および相互作用タンパク質間のタンパク質翻訳後修飾(PTM)の機能的関連について、既知および予測のデータを集めたリソースです。(1)同様の進化歴を有するPTMの対を抽出する「共同進化」チャネル、(2)3D構造の近くに修飾された残基を報告する「構造的距離」チャネル、(3)いくつかのPTMタイプによって修飾された残基を強調する「競合」チャネル、(4)文献に記載された関連PTM対を提供する「手動アノテーション」チャネル。 (5)高密度修飾タンパク質領域を計算する「ホットスポット」チャネルの情報を収集しています。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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