piRBase

保有機関：

Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (3件)： RNA , ゲノム/遺伝子 , エピジェネティクス

タグ【データの種類】 (3件)：配列 , 相互作用/パスウェイ , 書誌/ドキュメント

生物種 (19件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Macaca fascicularis (NCBI Taxonomy ID: 9541) , Macaca mulatta (NCBI Taxonomy ID: 9544) , Callithrix jacchus (NCBI Taxonomy ID: 9483) , Tupaia belangeri (NCBI Taxonomy ID: 37347) , Drosophila erecta (NCBI Taxonomy ID: 722) , Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 7245) , Drosophila virilis (NCBI Taxonomy ID: 7244) , Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986) , Bombyx mori (NCBI Taxonomy ID: 7091) , Nematostella vectensis (NCBI Taxonomy ID: 45351)

概要：

PIWI-interacting RNA (piRNA)の機能解析とアノテーションに関するデータベースです。生殖細胞に特異的なイベントに関与するPiwiタンパク質に結合するpiRNAを手動でキュレートし、配列、生物種、文献、ターゲットの情報を収録しています。piRNAやデータセットの検索が可能です。また、メチレーションのようなエピゲノミクスの情報やゲノムブラウザ、解析ツールも備えています。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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