資源
J-GLOBAL ID:202010001848347423   研究資源コード:NBDC02543 更新日:2020年09月08日

piRBase

piRBase
保有機関:
  • Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): RNA ,  ゲノム/遺伝子 ,  エピジェネティクス
タグ【データの種類】 (3件): 配列 ,  相互作用/パスウェイ ,  書誌/ドキュメント
生物種 (19件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Macaca fascicularis (NCBI Taxonomy ID: 9541) ,  Macaca mulatta (NCBI Taxonomy ID: 9544) ,  Callithrix jacchus (NCBI Taxonomy ID: 9483) ,  Tupaia belangeri (NCBI Taxonomy ID: 37347) ,  Drosophila erecta (NCBI Taxonomy ID: 722) ,  Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 7245) ,  Drosophila virilis (NCBI Taxonomy ID: 7244) ,  Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986) ,  Bombyx mori (NCBI Taxonomy ID: 7091) ,  Nematostella vectensis (NCBI Taxonomy ID: 45351)
概要:
PIWI-interacting RNA (piRNA)の機能解析とアノテーションに関するデータベースです。生殖細胞に特異的なイベントに関与するPiwiタンパク質に結合するpiRNAを手動でキュレートし、配列、生物種、文献、ターゲットの情報を収録しています。piRNAやデータセットの検索が可能です。また、メチレーションのようなエピゲノミクスの情報やゲノムブラウザ、解析ツールも備えています。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record.
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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