資源
J-GLOBAL ID:202010002134502995   研究資源コード:NBDC02457 更新日:2019年10月01日

CancerSEA: Cancer Single-cell State Atlas

CancerSEA: Cancer Single-cell State Atlas
保有機関:
  • Harbin Medical University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (5件): ゲノム/遺伝子 ,  遺伝的多様性 ,  RNA ,  細胞/オルガネラ ,  健康/疾患
タグ【データの種類】 (5件): 表現型 ,  配列 ,  発現 ,  分布 ,  分類
生物種 (1件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要:
25のがんタイプにおける、単一細胞レベルでの機能的な状態および遺伝子発現プロファイルを提供するデータベースです。シングルセルRNA-seqデータから情報を収集し、各細胞に14の機能的状態(stemness, invasion, metastasis, proliferationなど)およびタンパク質コード遺伝子・lncRNAの発現情報をアノテーションして格納しています。遺伝子名(リスト)を入力してがんタイプ毎の細胞機能との相関を見たり、細胞機能を選択して関連のある遺伝子リストを得たりすることができます。データのダウンロードも可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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