CropPAL

• Australian National Data Service (ANDS)
• Edwards Group, University of Western Australia

様々な作物におけるタンパク質の細胞内局在をワンストップで調べることができるデータベースです。大規模スケールのMS/MS(質量分析)結果、蛍光タグ実験の結果、ナズナの実験的タンパク質-タンパク質相互作用から推測されるタンパク質-タンパク質相互作用のデータが含まれています。cropPAL2になり、タンパク質の細胞内局在をバイオインフォマティクスで予測したデータと、予測と実験データを共に考慮に入れたコンセンサスな局在情報も含んでいます。キーワード検索やオルガネラを選ぶことで目的タンパク質とその細胞内局在を調べることができます。相互BLAST と EnsemblPLants の相同性ツリーにより、種々作物横断的に局在を検索することや、SUBA の Arabidopsis データと比較することもできます。