資源
J-GLOBAL ID:202010002146679262   研究資源コード:NBDC02177 更新日:2019年07月01日

CropPAL

CropPAL
保有機関:
  • Australian National Data Service (ANDS)
  • Edwards Group, University of Western Australia
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): タンパク質 ,  細胞/オルガネラ
タグ【データの種類】 (2件): 分布 ,  相互作用/パスウェイ
生物種 (4件): Hordeum vulgare (NCBI Taxonomy ID: 4513) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) ,  Triticum aestivum (NCBI Taxonomy ID: 4565) ,  Zea mays (NCBI Taxonomy ID: 4577)
概要:
様々な作物におけるタンパク質の細胞内局在をワンストップで調べることができるデータベースです。大規模スケールのMS/MS(質量分析)結果、蛍光タグ実験の結果、ナズナの実験的タンパク質-タンパク質相互作用から推測されるタンパク質-タンパク質相互作用のデータが含まれています。cropPAL2になり、タンパク質の細胞内局在をバイオインフォマティクスで予測したデータと、予測と実験データを共に考慮に入れたコンセンサスな局在情報も含んでいます。キーワード検索やオルガネラを選ぶことで目的タンパク質とその細胞内局在を調べることができます。相互BLAST と EnsemblPLants の相同性ツリーにより、種々作物横断的に局在を検索することや、SUBA の Arabidopsis データと比較することもできます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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