資源
J-GLOBAL ID:202010002187410146   研究資源コード:NBDC02009 更新日:2019年03月29日

Big Data Nucleic Acid Simulations Database: BIGNASim

Big Data Nucleic Acid Simulations Database: BIGNASim
保有機関:
  • Cataland Institution for Research and Advanced Studies (ICREA)
  • Barcelona Supercomputing Center (BSC)
  • Barcelona University
  • Institute for Research in Biomedicine
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): DNA
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  3D構造
生物種 (1件): All (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
核酸の構造に関する、原子論的ダイナミクスシミュレーション軌道と解析のためのデータベースです。核酸シミュレーションデータの保存および解析を行う上で完全なプラットフォームです。BIGNAS は、軌道データを保存する Cassandra、および解析とメタデータの格納を行う MongoDB の 2 つの noSQL データベースエンジンを搭載しています。利用可能な軌跡に対し、一般的な解析項目(らせんパラメータ、NMR 観測値、スティフネス、水素結合、スタッキングエネルギー、および形状)を事前に計算し、NAFlex インターフェースにより提供されるインタラクティブな可視化ツールを使用して表示します。全体の軌道、軌道の断片、またはメタ軌道は、分析し、またはさらなる分析を行うためダウンロードすることができます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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