Big Data Nucleic Acid Simulations Database: BIGNASim

保有機関：

Cataland Institution for Research and Advanced Studies (ICREA)
Barcelona Supercomputing Center (BSC)
Barcelona University
Institute for Research in Biomedicine

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (1件)： DNA

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 3D構造

生物種 (1件)： All (NCBI Taxonomy ID: 1)

概要：

核酸の構造に関する、原子論的ダイナミクスシミュレーション軌道と解析のためのデータベースです。軌道データを保存する Cassandra、および解析とメタデータの格納を行う MongoDB の 2 つの noSQL データベースエンジンを搭載しています。利用可能な軌跡に対し、一般的な解析項目(らせんパラメータ、NMR 観測値、スティフネス、水素結合、スタッキングエネルギー、および形状)を事前に計算し、NAFlex インターフェースにより提供されるインタラクティブな可視化ツールを使用して表示します。全体の軌道、軌道の断片、またはメタ軌道は、分析し、またはさらなる分析を行うためダウンロードすることができます。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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