資源
J-GLOBAL ID:202010002299628284   研究資源コード:NBDC02309 更新日:2019年03月29日

IMG/M: the integrated metagenome data management and comparative analysis system: IMG/M: the integrated metagenome data management and comparative analysis system

IMG/M: the integrated metagenome data management and comparative analysis system: IMG/M: the integrated metagenome data management and comparative analysis system
保有機関:
  • Biological Data Management and Technology Center, Lawrence Berkeley National Laboratory
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (10件): 書誌/ドキュメント ,  配列 ,  オントロジー/用語/命名法 ,  分類 ,  発現 ,  3D構造 ,  環境 ,  相互作用/パスウェイ ,  表現型 ,  手法
生物種 (4件): Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157) ,  Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2) ,  Eukaryota (NCBI Taxonomy ID: 2759) ,  Viruses (NCBI Taxonomy ID: 10239)
概要:
微生物のゲノムとマイクロバイオームのデータセットについてアノテーション、解析、分配をサポートするサイトです。DOE's Joint Genome Institute (JGI)で得られた配列にEBI Genome Reviews、RefSeq、UniProt/SwissProt、 UniProt/TrEMBL、InterPro、GO、Pfam、 KEGGなどから得られる情報を統合しています。また、公開方針に同意したユーザーから提供されたデータセットも収録し、公開しています。各データセットには生物名、GOLDデータベースへのリンクやトータルの塩基数、遺伝子数、機能予測した遺伝子などの情報および折り畳みやコンティグのゲノムブラウザ、染色体マップが収録されています。遺伝子、機能、ゲノムブラウザからの検索が可能です。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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