OncoBase

• Peking University Cancer Hospital and Institute
• Chinese Academy of Sciences
• University of Michigan

がんに関わる体細胞変異の統合データベースです。TCGA、ICGC、COSMIC、ClinVarから収集した体細胞変異について、アノテーションを行なっています。局所的なクロマチンシグネチャー、異なる細胞タイプにおける3Dクロマチン相互作用、エンハンサーとターゲットのネットワーク再構築を統合しています。クロマチン相互作用から推定されたエンハンサーとプロモーターの相互作用は体細胞変異とターゲット遺伝子を定量的に優先順位づけするネットワーク拡散システムに統合されます。キーワード検索やJbrowseから閲覧できます。