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J-GLOBAL ID:202010005406886541   研究資源コード:NBDC01924 更新日:2019年03月29日

ModBase database of comparative protein structure models: ModBase

ModBase database of comparative protein structure models: ModBase
保有機関:
  • Laboratory of Andrej Sali, University of California at San Francisco (UCSF)
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): タンパク質
タグ【データの種類】 (1件): 3D構造
生物種 (1件): All (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
アノテーションが付されたタンパク質構造比較モデルのデータベースです。モデルは、自動モデリングパイプラインの ModPipe により計算されます。ModPipe は、折り畳み割り当て、配列構造のアラインメント、モデル構築、モデル評価(http://salilab.org/modeller/)のためのモデラーに主に依存します。ModBase は現在、470 万個のユニークなタンパク質配列のドメインに対する信頼できるモデルを約 3,000 万個含んでいます。ModBaseを使用すると、ModWeb モデリングサーバー(http://salilab.org/modweb)へのインターフェイスを介して、オンデマンドで比較モデルを計算またはアップデートできます。ModBaseモデルは、Protein Model Portal(http://www.proteinmodelportal.org/)からも入手できます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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