資源
J-GLOBAL ID:202010005557651660   研究資源コード:NBDC02464 更新日:2019年10月09日

CoevDB

CoevDB
保有機関:
  • University of Lausanne
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (3件): 配列 ,  生物分類 ,  分類
生物種 (1件): Euteleostomi (NCBI Taxonomy ID: 117571)
概要:
タンパク質コード遺伝子の分子内共進化のデータベースです。脊椎動物亜門のうち現存する真口類(bony vertebrates, Euteleostomi)の中の8,000以上のタンパク質ファミリーについて共進化の予測結果を格納しています。共進化の予測には独自に開発したCoevソフトウェアを使用しています。共進化スコアの高いペアサイトの数が多い順に遺伝子リストを見られるページや、遺伝子名を指定して検索し、全ての分子内共進化ペアサイトをスコアの高い順に表示させるページ等があります。またそれぞれのページから、系統樹の表示ができます。全データの一括ダウンロードも可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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