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J-GLOBAL ID:202010005615580140   研究資源コード:NBDC01940 更新日:2019年03月29日

The Improved Database Of Chimeric Transcripts and RNA-Seq Data: ChiTaRS

The Improved Database Of Chimeric Transcripts and RNA-Seq Data: ChiTaRS
資源分類: データ・データベース
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (8件): Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) ,  Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823)
概要:
GenBank から得られた EST および mRNA は、2 つ以上の異なる遺伝子のキメラ RNA を同定するために使用されています。RNA の配列決定により数千のキメラ EST を分析することで、キメラ EST の発現レベルは一般に低く、かつ正常細胞において高度に組織特異的であることを突き止めました。本データベースは、ヒト、マウス、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、ウシ、ラット、ブタおよび酵母における約 4 万件のキメラ転写物を収録した ChiTaRS データベース (ChiTaRS-3.1) を改良したバージョンです。現在のバージョンでは、実験データのエビデンスを拡張しただけでなく、RT-PCR、qPCR、RNA 配列決定およびペプチド質量分析によって実験的に確認された同じ遺伝子のセンス-アンチセンスキメラ転写物のタイプを収録しています。さらに、本データベースは、ヒト、マウスおよびミバエの異なる組織における paired-end の RNA 配列決定実験によって同定されたされたキメラ RNA の発現レベルとともに、約11,700 件のヒト癌ブレイクポイントを収集しています。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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