The Improved Database Of Chimeric Transcripts and RNA-Seq Data: ChiTaRS

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (3件)： cDNA/EST , RNA , 健康/疾患

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 発現

生物種 (8件)： Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823)

概要：

キメラ転写物とRNAシークエンシングデータのデータベースです。ヒト、マウス、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、ウシ、ラット、ブタおよび酵母におけるキメラ転写物と、ヒトがんにおける染色体切断点を収録しています。実験データのエビデンスの拡張と、RT-PCR、qPCR、RNA シークエンシングおよびペプチド質量分析によって実験的に確認された同一遺伝子からのセンス-アンチセンスキメラ転写物データが付加されています。さらに各キメラデータに、予測されるChimeric Protein-Protein Interaction (ChiPPI) networkが追加され、親タンパク質及び融合タンパク質の相互作用パートナーの可視化が可能です。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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