資源
J-GLOBAL ID:202010006001714898   研究資源コード:NBDC02114 更新日:2019年03月29日

The UCSC Archaeal Genome Browser: The UCSC Archaeal Genome Browser

The UCSC Archaeal Genome Browser: The UCSC Archaeal Genome Browser
保有機関:
  • Department of Biomolecular Engineering, University of California Santa Cruz
  • Center for Biomolecular Science and Engineering, School of Engineering, University of California Santa Cruz
  • University of California
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): ゲノム/遺伝子 ,  DNA ,  RNA
タグ【データの種類】 (3件): 配列 ,  発現 ,  相互作用/パスウェイ
生物種 (2件): Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157) ,  Plasmodium falciparum (NCBI Taxonomy ID: 5833)
概要:
古細菌ドメインに属する 100 以上の微生物種の生物学的情報を提供するツールです。基本的な遺伝子アノテーションは、NCBI Genbank / RefSeq のエントリーから抽出されたものです。アノテーションには、複数の種、ヌクレオチドおよびタンパク質モチーフの配列保存、ノンコーディングRNA予測、オペロン予測、およびその他のバイオインフォマティクス分析結果がオーバーレイされています。さらに、利用可能な遺伝子発現データ(マイクロアレイまたはハイスループットRNAシークエンシング)が表示されます。本データベースは、古細菌を研究する研究室から寄せられる直接的な貢献やコメント(機能的ゲノムデータや、バイオインフォマティクス分析に関するもの)を歓迎しています。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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