資源
J-GLOBAL ID:202010006781900000   研究資源コード:NBDC01723 更新日:2019年05月19日

Bgee DataBase for Gene Expression Evolution: Bgee

Bgee DataBase for Gene Expression Evolution: Bgee
保有機関:
  • BGEE administrators
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (3件): 発現 ,  分布 ,  分類
生物種 (17件): Anolis carolinensis (NCBI Taxonomy ID: 28377) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Gorilla gorilla gorilla (NCBI Taxonomy ID: 9595) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Macaca mulatta (NCBI Taxonomy ID: 9544) ,  Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Ornithorhynchus anatinus (NCBI Taxonomy ID: 9258) ,  Pan paniscus (NCBI Taxonomy ID: 9597) ,  Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823) ,  Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)
概要:
複数のデータタイプ(RNA-Seq、Affymetrix、in situ ハイブリダイゼーション、および EST データ)から作成された複数の動物種の遺伝子発現パターンを検索・比較するためのデータベースです。正常な遺伝子の発現に関する比較の基準を提供するため、本データベースでは「正常」で健康な発現データのみを選定しています(例:遺伝子ノックアウトなし、治療なし、疾患なし)。発現の有無、および異なる過剰/過小発現の呼び出しを、遺伝子のオーソロジーに関する情報および器官間のホモロジーに関する情報と統合して生成します。これにより、異なる種間の発現パターンの比較が可能となります。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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