Bgee DataBase for Gene Expression Evolution: Bgee

保有機関：

BGEE administrators

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , 個体/種

タグ【データの種類】 (3件)：発現 , 局在 , 分類

生物種 (28件)： Anolis carolinensis (NCBI Taxonomy ID: 28377) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Branchiostoma lanceolatum (NCBI Taxonomy ID: 7740) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Canis lupus (NCBI Taxonomy ID: 9612) , Cavia porcellus (NCBI Taxonomy ID: 10141) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila ananassae (NCBI Taxonomy ID: 7217) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Drosophila mojavensis (NCBI Taxonomy ID: 7230) , Drosophila pseudoobscura (NCBI Taxonomy ID: 7237) , Drosophila simulans (NCBI Taxonomy ID: 7240) , Drosophila virilis (NCBI Taxonomy ID: 7244) , Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 7245) , Equus caballus (NCBI Taxonomy ID: 9796) , Erinaceus europaeus (NCBI Taxonomy ID: 9365) , Eumetazoa (NCBI Taxonomy ID: 6072) , Felis catus (NCBI Taxonomy ID: 9685) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Gorilla gorilla gorilla (NCBI Taxonomy ID: 9595) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Lepisosteus oculatus (NCBI Taxonomy ID: 7918) , Macaca mulatta (NCBI Taxonomy ID: 9544) , Metazoa (NCBI Taxonomy ID: 33208) , Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Ornithorhynchus anatinus (NCBI Taxonomy ID: 9258) , Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986)

概要：

複数のデータタイプ(bulk RNA-Seq、scRNA-Seq、Affymetrix、in situ ハイブリダイゼーション、および EST データ)から作成された複数の動物種の遺伝子発現パターンを検索・比較するためのデータベースです。正常な遺伝子の発現に関する比較の基準を提供するため、本データベースでは健康的で野生型の発現データのみを選定しています(例:遺伝子ノックアウトなし、治療なし、疾患なし)。発現の有無、および過剰/過小発現の差異に、遺伝子のオーソロジーに関する情報および器官間のホモロジーに関する情報を合して呼び出します。これにより、異なる種間の発現パターンの比較が可能となります。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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