カイコ参照トランスクリプトームデータ

• 国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部

カイコの組織別遺伝子発現データのデータベースです。カイコの新規リファレンスゲノム配列を用いてRNAseqで解析したカイコP50T系統の前部絹糸腺、後部絹糸腺、中部絹糸腺(前部・中部・後部)、中腸、脂肪体、マルピーギ管、精巣、卵巣のトランスクリプトームデータに、SRAから収集したデータも加え、TPM値で比較しています。カイコの各転写物をヒト、ショウジョウバエの遺伝子セットに対してBlast検索した結果をアノテーションとして示しています。データは国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構) 生物機能利用研究部門/農業情報研究センターによって作成され、生命科学系データベースアーカイブから公開されています。