資源
J-GLOBAL ID:202010009176775279
研究資源コード:NBDC02056
更新日:2020年07月09日
InterEvol database : Diving into the structure and evolution of protein complex interfaces
InterEvol database : Diving into the structure and evolution of protein complex interfaces
保有機関:
-
National Centre for Scientific Research (CNRS)
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (1件):
タンパク質
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 3D構造
生物種 (1件):
All (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
タンパク質の相互作用について構造と進化を解析するためのデータベースです。相互作用の構造を扱うInterEvolDB、アミノ酸配列を扱うInterEvolAlign、両方の情報を組み合わせて解析するInterEvolPymol pluginの3つで構成されています。
InterEvolDB:相互作用鎖のトポロジー、複合体の一般情報、相同な相互作用鎖や構造のリスト。PDB IDやキーワードによる検索が可能。
InterEvolAlign:相互作用するアミノ酸配列からのアラインメント。
InterEvolPymol plugin:相互作用インターフェイスの可視化とシーケンスアラインメント。
また複合体パートナー中の複数の配列アラインメントから得られた進化的情報と統計的ポテンシャルを組み合わせたヘテロメリックタンパク質インターフェースのスコアリング機能を持つツール InterEvScore Potential も提供されています。
作成機関:
FAIRsharing
レコード管理者:
See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件:
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license
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