統合がんゲノムデータポータル

• 公益財団法人がん研究会 癌研究所

がんゲノム研究で集積されたゲノム、トランスクリプトーム、miRNAなどの研究プロジェクトに関する情報を整理したデータベースです。研究プロジェクトの概要、検体の解析方法、患者から提供された検体の属性(正常、腫瘍、性別、年代など)、臨床情報などを収録しています。ゲノムデータは、NBDCヒトデータベース (https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01348 ) に登録されており、アクセション番号と検体の属性情報とを掲載しています。また、トランスクリプトームおよびmiRNAデータは、NCBIのGEO (Gene Expression Omnibus)にも登録されています。がん種やデータの種類(WGS、WES 、mRNAトランスクリプトーム、miRNAトランスクリプトーム、アレイ 、RNA-seq 、RT-PCR)による絞り込みが可能です。 統合がんゲノムデータベース (https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00760 )の改訂版です。