資源
J-GLOBAL ID:202010009280144825
研究資源コード:NBDC02521
更新日:2020年04月22日
SSRome
SSRome
保有機関:
-
Agricultural Genetic Engineering Research Institute
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (5件):
遺伝的多様性
, ゲノム/遺伝子
, DNA
, 細胞/オルガネラ
, 個体/種
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 手法
生物種 (1件):
All (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
マイクロサテライトのデータベースです。生物種ごとにさまざまなSSRやマイクロサテライトマーカーの配列を収集しています。種名と繰り返しの型を指定すると、primer IDごとに、SSRのある配列のNCBI ID、Primer配列、SSRの繰り返し回数と配列、遺伝子産物の長さ、NCBIやGenBankへのリンクなどがリストされます。遺伝子上、非遺伝子上、ミトコンドリアおよび葉緑体ゲノム上のSSRが検索できます。ユーザ自身でアップロードした配列について、SSRの特徴を解析したり、データベース内のSSRと比較したりすることもできます。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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