資源
J-GLOBAL ID:202010009832804906   研究資源コード:NBDC02058 更新日:2019年03月29日

MAPPER-2: mapperdb

MAPPER-2: mapperdb
保有機関:
  • University of Florida
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  タンパク質
生物種 (3件): Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
概要:
3つのゲノムにおける遺伝子の上流ノンコーディング配列データ情報を掲載し、転写因子結合部位(TFBS)に関する知見を提供するデータベースです。各転写について、スキャンされた領域は転写が開始される上流 10,000bp から配列コーディングが開始される下流 50bp にわたります。したがって、データベースには、遺伝子プロモーターにおける、および初期のイントロンおよびノンコーディングエクソンにおける推定結合部位が含まれます。各推定結合部位について提示される情報には、転写因子名、その位置(染色体上の絶対的位置または遺伝子の相対的位置)、予測スコア、および部位が属する遺伝子の領域などがあります。選択された遺伝子が他の2種類の生物において相同体を有する場合、このプログラムはオプションでその総胴体における推定 TFBS を表示することができます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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