OpenProt

保有機関：

Université de Sherbrooke

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：タンパク質 , ゲノム/遺伝子

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 発現

生物種 (10件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Saccharomyces cerevisiae S288c (NCBI Taxonomy ID: 559292) , Ovis aries (NCBI Taxonomy ID: 9940)

概要：

Open reading frames (ORFs)のデータベースです。真核生物10種の30コドン以上のORFについて、既知のタンパク質(RefProt)、新規予測アイソフォーム(Isoform)、代替ORFによる新規予測タンパク質(AltProt)についてアノテーションを付与しています。また質量分析やリボソームプロファイリングの検出、タンパク質の相同性、機能ドメインの予測など、各タンパク質の裏付けとなる証拠も収録しています。種間でのBLAST検索が可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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