資源
J-GLOBAL ID:202010012966473982
研究資源コード:NBDC02118
更新日:2020年07月09日
Whole-Cell Knowledge Base: WholeCellKB
Whole-Cell Knowledge Base: WholeCellKB
保有機関:
-
Karr Lab, Institute for Multiscale Biology & Genomics
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (5件):
ゲノム/遺伝子
, RNA
, 細胞/オルガネラ
, 個体/種
, 健康/疾患
タグ【データの種類】 (3件):
配列
, 発現
, 相互作用/パスウェイ
生物種 (1件):
Mycoplasma genitalium (NCBI Taxonomy ID: 2097)
概要:
全細胞モデルを実現するべく設計された、モデル生物データベースのオープンアクセスコレクションです。現在、グラム陽性細菌で一般的なヒト病原体であるマイコプラズマ・ジェニタリウムのデータベースが収録されています。マイコプラズマ・ジェニタリウムデータベースは、900以上の主要な研究論文、レビュー、書籍、データベースから染色体、転写ユニット、遺伝子、代謝物質、タンパク質、転写調節、反応、パスウェイなど包括的な情報を収録しています。また、BioCyc、KEGG、UniProtを含む外部のリソースと広く相互参照しています。WholeCellKB は、モデル生物データベースを構築するためのオープンソースのWebベースのソフトウェアプログラムも提供しています。WholeCellKB ソフトウェアは、個々の種を完全に記述する広範で自由にカスタマイズ可能なデータモデル(各遺伝子、タンパク質、反応、およびパスウェイ構造および機能を含む)を提供します。ウェブベースのユーザーインターフェイスや、RESTful ウェブサービスを介し、自由にアクセスできます。
作成機関:
FAIRsharing
レコード管理者:
See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件:
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license
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