資源
J-GLOBAL ID:202010012966473982   研究資源コード:NBDC02118 更新日:2019年03月29日

Whole-Cell Knowledge Base: WholeCellKB

Whole-Cell Knowledge Base: WholeCellKB
保有機関:
  • Karr Lab, Institute for Multiscale Biology & Genomics
資源分類: データ・データベース
生物種 (1件): Mycoplasma genitalium (NCBI Taxonomy ID: 2097)
概要:
全細胞モデルを実現にするべく設計された、モデル生物データベースのオープンアクセスコレクションです。現在、マイコプラズマ・ジェニタリウム、グラム陽性細菌、および一般的なヒト病原体のデータベースが収録されています。マイコプラズマ・ジェニタリウムデータベースは、過去の単一生物の中で最も包括的な記述を有し、初めての全細胞計算モデルを開発するために使用されたものです。このデータベースは、900以上の主要な研究論文、レビュー、書籍、データベースから構成されており、BioCyc、KEGG、UniProtを含む外部のリソースと広く相互参照しています。WholeCellKB は、モデル生物データベースを構築するためのオープンソースのWebベースのソフトウェアプログラムも提供しています。WholeCellKB ソフトウェアは、個々の種を完全に記述する広範で自由にカスタマイズ可能なデータモデル(各遺伝子、タンパク質、反応、および経路の構造および機能を含む)を提供します。ウェブベースのユーザーインターフェイスや、RESTful ウェブサービスを介し、自由にアクセスできます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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