GWIPS-viz

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (3件)：ゲノム/遺伝子 , RNA , タンパク質

タグ【データの種類】 (4件)：発現 , 相互作用/パスウェイ , 手法 , 書誌/ドキュメント

生物種 (21件)： Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Bacillus subtilis (NCBI Taxonomy ID: 1423) , Bacteriophage lambda (NCBI Taxonomy ID: 10710) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Caulobacter crescentus (NCBI Taxonomy ID: 155892) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Human herpesvirus 5 strain Merlin (NCBI Taxonomy ID: 295027) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Neurospora crassa (NCBI Taxonomy ID: 5141) , Plasmodium falciparum (NCBI Taxonomy ID: 5833) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Schizosaccharomyces pombe (NCBI Taxonomy ID: 4896) , Staphylococcus aureus (NCBI Taxonomy ID: 1280) , Streptomyces coelicolor (NCBI Taxonomy ID: 1902) , Trypanosoma brucei (NCBI Taxonomy ID: 5691) , Xenopus laevis (NCBI Taxonomy ID: 8355) , Zea mays (NCBI Taxonomy ID: 4577)

概要：

リボソームプロファイリング法を用いて得られたRibo-seqデータの解析および視覚化のためのオンラインゲノムブラウザです。UCSC Genome Browserをベースに開発されています。公開されている研究を基に予め入力したRibo-seqトラックを mRNA-seq トラックとともに提供します。ダウンロードページから、bigWig形式でのアラインメントファイルのダウンロードも可能です。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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