SitEx database of eukaryotic protein functional sites: SitEx

保有機関：

The Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics Lab
Novosibirsk State University

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , タンパク質

タグ【データの種類】 (3件)：配列 , 分類 , 3D構造

生物種 (18件)： Anopheles gambiae (NCBI Taxonomy ID: 7165) , Ascaris suum (NCBI Taxonomy ID: 6253) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Canis familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615) , Cavia porcellus (NCBI Taxonomy ID: 10141) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Echis multisquamatus (NCBI Taxonomy ID: 93050) , Equus caballus (NCBI Taxonomy ID: 9796) , Eukaryota (NCBI Taxonomy ID: 2759) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986) , Protobothrops flavoviridis (NCBI Taxonomy ID: 88087) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823) , Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)

概要：

真核生物のタンパク質機能部位に関する情報を含むデータベースです。機能部位におけるアミノ酸配列と位置を、コーディング遺伝子のエクソン構造との関連とともに収録しています。PDB ID、生物種、リガンド、エキソンの長さなどによる検索のほか、BLASTやPDBファイルによる検索も可能です。タンパク質進化におけるシャッフリングに関与するエクソンを発見するため、またはタンパク質工学実験を設計するために使用することができます。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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