The Mass Genome Annotation Data Repository: MGA

保有機関：

Ecole Polytechnique Federale de Lausanne
SIB Swiss Institute of Bioinformatics

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , 遺伝的多様性

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 相互作用/パスウェイ

生物種 (10件)： Apis mellifera (NCBI Taxonomy ID: 7460) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Schizosaccharomyces pombe (NCBI Taxonomy ID: 4896) , Zea mays (NCBI Taxonomy ID: 4577)

概要：

公開された次世代シーケンシングデータおよびその他のゲノムアノテーションデータ(転写開始部位、SNP など)を標準フォーマット(SGA: Simple Genome Annotation)で保存するリポジトリです。配列の生データではなく、各生物種ゲノムへのマッピングデータを提供しています。これらのデータは、キュレータによりマニュアルキュレーションされています。MGA-searchページから、データのキーワード検索が行えます。MGA Data Overviewページからは、生物種や実験を選択したデータのブラウジングが可能です。また、FTPサイトからSGA形式データのダウンロードが行えます。さらに、「ChIP-seq」ツールやSSA サーバーを利用して様々な解析を行うことができます。

作成機関： FAIRsharing

レコード管理者： See the corresponding part in the FAIRsharing record

本レコードの利用条件： Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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