資源
J-GLOBAL ID:202010015016920370   研究資源コード:NBDC02548 更新日:2020年11月24日

MiGD: Mikan Genome Database

MiGD: Mikan Genome Database
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): ゲノム/遺伝子 ,  遺伝的多様性 ,  DNA
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (8件): Citrus unshiu (NCBI Taxonomy ID: 55188) ,  Citrus trifoliata (NCBI Taxonomy ID: 37690) ,  Citrus clementina (NCBI Taxonomy ID: 85681) ,  Citrus sinensis (NCBI Taxonomy ID: 2711) ,  Citrus maxima (NCBI Taxonomy ID: 37334) ,  Citrus cavaleriei (NCBI Taxonomy ID: 2709) ,  Citrus medica (NCBI Taxonomy ID: 171251) ,  Atalantia buxifolia (NCBI Taxonomy ID: 76974)
概要:
ミカンゲノムデータベース(Mikan Genome Database: MiGD)はカンキツ育種のためのDNAマーカー開発支援を目的としたゲノムデータベースです。
ゲノムブラウザTASUKEを用いて、9種のカンキツのDNA多型情報を比較して見ることができます。
MiGDチームにより解読されたウンシュウミカン(C. unshiu)およびカラタチ(P. trifoliata)の全ゲノム配列と遺伝子アノテーション情報はゲノムブラウザJBrowseで閲覧できる他、ダウンロードも可能です。
CAPSマーカーデータベースには約2,700種類のCAPSマーカーのプライマー配列やC. unshiuおよびP. trifoliataのゲノム上の位置情報などが収録されています。
また、4種のカンキツゲノムに対してのBLAST検索も可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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