MiGD: Mikan Genome Database

保有機関：

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (3件)：ゲノム/遺伝子 , 遺伝的多様性 , DNA

タグ【データの種類】 (1件)：配列

生物種 (8件)： Citrus unshiu (NCBI Taxonomy ID: 55188) , Citrus trifoliata (NCBI Taxonomy ID: 37690) , Citrus clementina (NCBI Taxonomy ID: 85681) , Citrus sinensis (NCBI Taxonomy ID: 2711) , Citrus maxima (NCBI Taxonomy ID: 37334) , Citrus cavaleriei (NCBI Taxonomy ID: 2709) , Citrus medica (NCBI Taxonomy ID: 171251) , Atalantia buxifolia (NCBI Taxonomy ID: 76974)

概要：

ミカンゲノムデータベース(Mikan Genome Database: MiGD)はカンキツ育種のためのDNAマーカー開発支援を目的としたゲノムデータベースです。
ゲノムブラウザTASUKEを用いて、9種のカンキツのDNA多型情報を比較して見ることができます。
MiGDチームにより解読されたウンシュウミカン(C. unshiu)およびカラタチ(P. trifoliata)の全ゲノム配列と遺伝子アノテーション情報はゲノムブラウザJBrowseで閲覧できる他、ダウンロードも可能です。
CAPSマーカーデータベースには約2,700種類のCAPSマーカーのプライマー配列やC. unshiuおよびP. trifoliataのゲノム上の位置情報などが収録されています。
また、4種のカンキツゲノムに対してのBLAST検索も可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

前のページに戻る