資源
J-GLOBAL ID:202010017254354806
研究資源コード:NBDC02476
更新日:2022年07月21日
FusionGDB2: Fusion Gene annotation DataBase
FusionGDB2: Fusion Gene annotation DataBase
保有機関:
-
University of Texas Health Science Center at Houston
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (3件):
ゲノム/遺伝子
, DNA
, 健康/疾患
タグ【データの種類】 (3件):
配列
, 発現
, 相互作用/パスウェイ
生物種 (1件):
Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要:
がんに関わる融合遺伝子のデータベースです。 Entrez mRNA sequence librariesとChiTars 5.0 、ChimerDB 4.0から得られたTCGAデータをもとに、融合遺伝子の概要、遺伝子オントロジー、ORF情報、アミノ酸配列や塩基配列、タンパク質相互作用、関連する薬剤と疾患の情報を収録しています。FusionAI のディープラーニングによる染色体切断傾向の情報やFGviewerにより可視化したタンパク質レベルでの融合パートナー遺伝子の保持情報も付加しています。
FusionGDB(https://ccsm.uth.edu/FusionGDB/ )の後継サイトです。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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