資源
J-GLOBAL ID:202010018136040216   研究資源コード:NBDC02484 更新日:2019年11月05日

MethMotif

MethMotif
保有機関:
  • Cancer Science Institute of Singapore
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (5件): ゲノム/遺伝子 ,  エピジェネティクス ,  DNA ,  タンパク質 ,  細胞/オルガネラ
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  相互作用/パスウェイ
生物種 (2件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
概要:
DNAメチル化プロファイルと統合した転写因子結合サイトのデータベースです。
転写因子結合部位(TFBS: transcription factor binding sites)について、ChIP-seqとWhole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS)の組み合わせから計算された細胞型特異的CpGメチル化情報と共にTFBS位置特異的重みマトリックスを収録しています。ChIP-seqとWGBSのデータはENCODEおよびGEOからダウンロードしています。全てのChIP済みタンパク質のピーク領域を囲むDNAメチル化レベルを細胞タイプごとにヒートマップから選択したり、2次元TFBS一覧からの閲覧や絞り込みができます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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