資源
J-GLOBAL ID：202010018136040216
研究資源コード：NBDC02484
更新日：2019年11月05日
MethMotif
MethMotif
保有機関：
-
Cancer Science Institute of Singapore
資源分類：
データ・データベース
タグ【対象】 (5件)：
ゲノム/遺伝子
, エピジェネティクス
, DNA
, タンパク質
, 細胞/オルガネラ
タグ【データの種類】 (2件)：
配列
, 相互作用/パスウェイ
生物種 (2件)：
Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
概要：
DNAメチル化プロファイルと統合した転写因子結合サイトのデータベースです。
転写因子結合部位(TFBS: transcription factor binding sites)について、ChIP-seqとWhole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS)の組み合わせから計算された細胞型特異的CpGメチル化情報と共にTFBS位置特異的重みマトリックスを収録しています。ChIP-seqとWGBSのデータはENCODEおよびGEOからダウンロードしています。全てのChIP済みタンパク質のピーク領域を囲むDNAメチル化レベルを細胞タイプごとにヒートマップから選択したり、2次元TFBS一覧からの閲覧や絞り込みができます。
作成機関：
NBDC
レコード管理者：
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件：
Creative Commons CC0 license
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