資源
J-GLOBAL ID:202010018143423813   研究資源コード:NBDC02188 更新日:2020年07月09日

mirDNMR

mirDNMR
保有機関:
  • Wenzhou Medical University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): ゲノム/遺伝子 ,  遺伝的多様性 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  発現
生物種 (1件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要:
遺伝子中心のバックグラウンド 新生突然変異率(DNMR : novo mutation rate) のデータベースです。異なる方法および集団の変動データから得られたバックグラウンドDNMRや各遺伝子のヒト遺伝子変異データベースにおける変異アレル頻度を収録しています。データベースには次の機能があります。(i) 次の 4 つの方法によって予測された各遺伝子のバックグラウンドDNMRをブラウズし、検索する:GC コンテンツ(DNMR-GC)、配列コンテキスト(DNMR-SC)、遺伝子の長さ、変異タイプ、生物学的進化などの複数因子(DNMR-MF)および局所的 DNA メチル化レベル(DNMR-DM)、 (ii)ExAC、ESP6500、UK10K、1000G、 dbSNP などの公開されているデータベースの変異頻度を検索する、(iii)3つの統計的方法(TADA、二項検定、ポアソン検定)を用いて、4 種のバックグラウンド DNMR に基づいて候補遺伝子に優先順位を付けるための DNM 負荷を調べる、 (iv)バックグラウンドDNMRに基づく遺伝子リストのフィルタリング、およびヒトの遺伝子変異データベースにおける様々なタイプの変異体の分布、(v)知的障害および制御のための背景遺伝子ベースのDNMR(DNMR-GC、DNMR-SC、DNMR-MF、DNMR-DM、DNMR-平均)およびトリマーベースのWES / WGSからの制御をダウンロードします。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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