CREEDS: Crowd Extracted Expression of Differential Signatures

• Icahn School of Medicine at Mount Sinai

遺伝子、疾患、薬物間の関連性についてのデータベースです。Gene Expression Omnibus (GEO) から得られた大量の遺伝子発現プロファイルを注釈付けし再分析するクラウドソーシングプロジェクトによって、単一遺伝子摂動、疾患と正常の対比、薬物摂動が手動で注釈付けられています。また、遺伝子の関連性がBubble ChartやClustergramにより可視化されています。各シグネチャには遺伝子名、機能、GEO ID、発現細胞、Enrichrによる上流や下流遺伝子情報へのリンクなどが収録されています。キーワードや上流下流遺伝子セットによる検索が可能です。