資源
J-GLOBAL ID:202010019545552756   研究資源コード:NBDC02167 更新日:2020年07月09日

CAMPSign

CAMPSign
保有機関:
  • National Institute for Research in Reproductive Health (NIRRH)
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): タンパク質
タグ【データの種類】 (2件): 手法 ,  分類
概要:
CAMPR3 (Collection of Anti-Microbial Peptides) データベースに含まれる 45 の主要な抗菌性ペプチド (AMP) ファミリーに属する抗菌ペプチドを同定するためのツールです。ペプチドは、実験的に明らかにされている AMP のために生成されたパターンおよび HMM(隠れマルコフモデル) のようなファミリーのシグネチャーに基づいて同定されます。ユーザーは、これらの AMP シグネチャーの存在をスクリーニングするために配列を登録することができます。さらに目的の配列をBLAST にかけ、CAMP、APD、AVPdb、BACTIBASE などの一般的な AMP データベース内の相同配列を探すことができます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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