Nucleic Acid Phylogenetic Profile: NAPP

• Gautheret Lab, Institute for Integrative Biology of the Cell

配列決定された1000 以上の細菌ゲノムのリストに含まれる任意のゲノムから、RNAリッチのクラスターを検索することができるデータベースです。参照ゲノムの遺伝子間領域を、重なり合う50塩基毎のセグメントにタイル化し、全てのタイルとタンパク質コード配列を出現プロファイルに基づいて分類しています。RNA リッチのクラスターは個別に見ることができる他、RNA リッチクラスターの全てのタイルを大きな要素へと連結し、ゲノムブラウザ、または他の予測/RNA配列実験との比較に使用するための CSV または GFF ファイルとして抽出することができます。