資源
J-GLOBAL ID:202010019608394960
研究資源コード:NBDC02069
更新日:2024年07月28日
Nucleic Acid Phylogenetic Profile: NAPP
Nucleic Acid Phylogenetic Profile: NAPP
保有機関:
-
Gautheret Lab, Institute for Integrative Biology of the Cell
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (1件):
RNA
タグ【データの種類】 (2件):
分類
, 配列
生物種 (2件):
Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157)
, Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2)
概要:
配列決定された1000 以上の細菌ゲノムのリストに含まれる任意のゲノムから、RNAリッチのクラスターを検索することができるデータベースです。参照ゲノムの遺伝子間領域を、重なり合う50塩基毎のセグメントにタイル化し、全てのタイルとタンパク質コード配列を出現プロファイルに基づいて分類しています。RNA リッチのクラスターは個別に見ることができる他、RNA リッチクラスターの全てのタイルを大きな要素へと連結し、ゲノムブラウザ、または他の予測/RNA配列実験との比較に使用するための CSV または GFF ファイルとして抽出することができます。
作成機関:
FAIRsharing
レコード管理者:
See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件:
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license
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