資源
J-GLOBAL ID:202010019833232693   研究資源コード:NBDC02534 更新日:2020年06月09日

LncACTdb 2.0

LncACTdb 2.0
保有機関:
  • College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): ゲノム/遺伝子 ,  RNA ,  健康/疾患
タグ【データの種類】 (3件): 表現型 ,  配列 ,  相互作用/パスウェイ
生物種 (1件): all (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
ceRNAs (competing endogenous RNAs) の相互作用のデータベースです。手動でキュレート、もしくは予測されたceRNAsについて、ceRNAとなるRNAと、これらと結合するmiRNAの情報、由来生物種や組織・細胞株の情報、関連形質・疾患、実験方法、参考文献、機能に関する情報を収録しています。ceRNAsとしては、内因的に生成された分子(lncRNA、環状RNA、コード遺伝子、偽遺伝子を含む)および外因的に導入された分子(ウイルスRNA、人工的に操作されたRNAを含む)を含んでいます。予測されたceRNAと実験的に同定されたceRNAに分けて検索、ブラウズが可能で、ブラウズではceRNAのタイプや、ceRNA、miRNA、生物種、形質・疾患を選んでデータを絞ることができます。また、BLAST検索もできます。ユーザがRNA情報を入力して機能を閲覧したり、生存性解析、ceRNAネットワーク表示を行うツールや、発現プロファイルを入力して機能的なceRNAを探すツールも用意されています。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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