資源
J-GLOBAL ID:202010020254703089   研究資源コード:NBDC02218 更新日:2019年06月25日

Microbial Genome Annotation & Analysis Platform: MicroScope

Microbial Genome Annotation & Analysis Platform: MicroScope
保有機関:
  • Laboratoire d'Analyses Bioinformatiques pour la Genomique et le Metabolisme (LABGeM)
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): ゲノム/遺伝子
タグ【データの種類】 (4件): 配列 ,  相互作用/パスウェイ ,  分類 ,  オントロジー/用語/命名法
生物種 (1件): Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2)
概要:
MicroScope は微生物の比較ゲノム解析と手動機能アノテーションのためのオンラインプラットフォームです。そのリレーショナルデータベーススキーマには、シンタックスおよび機能的アノテーションパイプラインの事前計算結果、ならびに各ゲノムに固有の経路ツールおよび代謝解析が格納されています。
各ゲノム上の遺伝子について、類似配列、配列からの機能予測(InterProドメイン予測など)、代謝ネットワーク予測、実験からの機能予測など、遺伝子アノテーションを付与するための様々な情報を提供しています。ゲノムの解析とアノテーション、メタゲノム配列の解析とアノテーション、RNAseqデータのリファレンスゲノムへのマッピングと発現解析、異なる進化系統間のSNP/indelの抽出に利用できます。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

前のページに戻る