Microbial Genome Annotation & Analysis Platform: MicroScope

• Laboratoire d'Analyses Bioinformatiques pour la Genomique et le Metabolisme (LABGeM)

MicroScope は微生物の比較ゲノム解析と手動機能アノテーションのためのオンラインプラットフォームです。リレーショナルデータベーススキーマを用いて統語論的および機能的アノテーションパイプラインの事前計算結果、ならびに各ゲノムに固有のパスウェイツールおよび代謝解析を収録しています。
各ゲノム上の遺伝子について、類似配列、配列からの機能予測(InterProドメイン予測など)、代謝ネットワーク予測、実験からの機能予測など、遺伝子アノテーションを付与するための様々な情報を提供しています。ゲノムの解析とアノテーション、メタゲノム配列の解析とアノテーション、RNAseqデータのリファレンスゲノムへのマッピングと発現解析、異なる進化系統間のSNP/indelの抽出に利用できます。