資源
J-GLOBAL ID:202010020408718980   研究資源コード:NBDC02419 更新日:2019年06月11日

GenEpid-J: Database of Pathogen Genomics and Epidemiology

GenEpid-J: Database of Pathogen Genomics and Epidemiology
保有機関:
  • 厚生労働省 国立感染症研究所
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (5件): ゲノム/遺伝子 ,  薬 ,  遺伝的多様性 ,  個体/種 ,  健康/疾患
タグ【データの種類】 (4件): 表現型 ,  環境 ,  配列 ,  分布
生物種 (15件): Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Klebsiella pneumoniae (NCBI Taxonomy ID: 573) ,  Enterobacter cloacae (NCBI Taxonomy ID: 550) ,  Salmonella (NCBI Taxonomy ID: 590) ,  Klebsiella oxytoca (NCBI Taxonomy ID: 571) ,  Serratia marcescens (NCBI Taxonomy ID: 615) ,  Enterococcus faecium (NCBI Taxonomy ID: 1352) ,  Klebsiella aerogenes (NCBI Taxonomy ID: 548) ,  Citrobacter freundii (NCBI Taxonomy ID: 546) ,  Pseudomonas aeruginosa (NCBI Taxonomy ID: 287) ,  Vibrio cholerae (NCBI Taxonomy ID: 666) ,  Dengue virus (NCBI Taxonomy ID: 12637) ,  Staphylococcus (NCBI Taxonomy ID: 1279) ,  Mycobacterium tuberculosis (NCBI Taxonomy ID: 1773) ,  Norovirus (NCBI Taxonomy ID: 142786)
概要:
薬剤耐性菌のゲノムデータベースです。国内外で分離された患者・家畜・環境など様々な由来の菌株について、プラスミドゲノムと染色体ゲノムを分離したうえで解読・解析し、付随する疫学情報と共にデータベースとして蓄積しており、特定の耐性遺伝子についてその分布状況を迅速に把握することができます。AMED研究班員のみ内部データベースが利用できます。外部研究者が閲覧できるのは、薬剤耐性菌(AMR)およびコレラ菌についての解読・登録数の外観のマップ表示のみですが、関連の各種ツールが利用できます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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