資源
J-GLOBAL ID:202010020659950504
研究資源コード:NBDC02509
更新日:2020年03月31日
LncRRIsearch
LncRRIsearch
保有機関:
-
産総研・早大 生体システムビッグデータ解析 オープンイノベーションラボラトリ
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
RNA
, ゲノム/遺伝子
タグ【データの種類】 (4件):
相互作用/パスウェイ
, 配列
, 発現
, 分布
生物種 (2件):
Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
概要:
long non-coding RNA(lncRNA)-mRNAまたはlncRNA-lncRNA間の相互作用の網羅的な予測をするためのウェブサーバーです。予測されるローカルな塩基対相互作用について、クエリとターゲットの情報(Gene ID、Transcript ID、染色体上位置、転写長など)、塩基対同士の距離、組織ごとの発現量、細胞内の局在状況、全体的な相互作用のエネルギー、相互作用する局所的配列の情報などを提供します。 遺伝子/代謝物名や,組織特異的発現パターン,RNA転写物の細胞内局在で検索することができます。現在ヒトおよびマウスのデータが利用可能です。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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